In der Slowakei werden derzeit ein Krankenhaus, ein Tageszentrum für obdachlose Menschen und eine Apotheke vom Orden der Barmherzigen Brüder geführt. Ein Krankenhaus und eine Einrichtung für Menschen mit Behinderungen sind verpachtet.
Bratislava
Das Krankenhaus der Barmherzigen Brüder in Bratislava hat 383 Mitarbeiter*innen und verfügt über 122 Betten, ein Ärztezentrum und 49 Ambulanzen. Ebenfalls dazu gehört ein Ärztezentrum mit 11 Ambulanzen in Dunajská Lužná, 2 Ambulanzen in Pezinok, 3 Ambulanzen in Rovinka sowie 1 Ambulanz in Stupava.
Ebenfalls in Bratislava führen die Barmherzigen Brüder ein Tageszentrum mit Hygienezentrum für obdachlose Menschen. Ein Teil des Hauses ist an den Lazaristenorden vermietet, der hier 30 Betten für kranke Obdachlose anbietet.
Spisské Podhradie
Die Einrichtung für Menschen mit körperlichen und geistigen Behinderungen der Barmherzigen Brüder in Spisské Podhradie verfügt über 120 Plätze und wird vom Land Prešov in Kooperation mit dem Orden geführt.
Skalica
Seit 1991 beherbergt das Haus in Skalica ein Lehrkrankenhaus mit 10 Stationen und 32 Fachambulanzen. Der Staat führt das Krankenhaus, die Gebäude befinden sich im Besitz des Ordens.