Die Abteilung  für Chirurgie mit Schwerpunkt Gefäßmedizin gilt als führend in der Behandlung von Durchblutungsstörungen sowie dem Aortenaneurysma.

Die Augenklinik vereint das gesamte Spektrum der Augenheilkunde mit ausgewählten Spezialbereichen, wie Sehschule, Augenlaserzentrum und das Klinische Institut für Spezialsehhilfen.

Durch die spitalsübergreifende Zusammenarbeit gehört die gynäkologisch-geburtshilfliche Abteilung zu einer der größten des Landes. Der Schwerpunkt bei den Brüdern liegt in der Geburtshilfe.

Neben der stationären und ambulanten Versorgung hat sich die Abteilung auf Intensiv- und Notfallmedizin spezialisiert. Ein weiterer Schwerpunkt liegt in der landesweiten Betreuung von Diabetes-Patienten.

Primärer Hauptschwerpunkt ist die Akutversorgung bei Schlaganfall sowie   Diagnose und Behandlung von komplexen, neurologischen Erkrankungen. 

Das Institut für Sinnes- und Sprachneurologie gilt als Vorreiter in der gesamten Entwicklungsmedizin, insbesondere in den Bereichen Kommunikation, Sprache, Hören und Lernen.

Die Radiologie behandelt zwei Kernaufgabengebiete. Einerseits die bildgebende Diagnostik und andererseits die interventionelle Radiologie.

Die Abteilung stellt als standortübergreifende Organisationseinheit die anästhesiologische, intensivmedizinische und notfallmedizinische Betreuung sicher.

Gebündelte Kompetenz der drei Ordenskrankenhäuser (OKH) Barmherzige Brüdern Linz, Ordensklinikum Linz Barmherzige Schwestern und Elisabethinen.